根据现有信息，杨凌区包含的行政村主要有以下两类：

一、国家级荣誉相关村庄

美丽宜居示范村

新集村（揉谷镇）

陵东村（揉谷镇）

汤家村（五泉镇）

国家森林乡村

元树村（杨陵街道）

崔东沟村（杨陵街道）

二、地理行政区划相关村庄

街道与乡镇下属村庄

包括杨陵街道、五泉镇、杨村乡、李台乡、大寨乡、揉谷乡等下属的行政村，例如：

杨陵街道：元树村、崔东沟村

五泉镇：周李村、汤家村

涉及的行政村总数达50余个

三、其他类型村庄

城中村

梁氏窑村、付家庄村、姚南村等6个位于杨陵街道的城中村

以上信息综合了国家级评选结果、政府公开数据及地理行政区划信息，涵盖近年获得的荣誉及行政范围。