新疆本土的骆驼品种主要有以下两种：

一、原生品种

新疆驼

分布于新疆全境，以北疆为主（占比64%），尤其集中在阿勒泰、塔城地区（占全疆骆驼总数的24.35%）。 - 体型较大，体重450-650公斤，年产毛量3-5公斤，公驼可达14公斤。

长眉骆驼

中国独有的稀有品种，分布于新疆木垒县境内的罗布泊国家级自然保护区（面积6.12万平方公里）。 - 特征为眉毛更长更密，属于国家一级保护动物和世界极度濒危物种。

二、地方特色品种

阿拉善驼

主要产自内蒙古阿拉善地区，以“骆驼之乡”闻名，年产毛3.5-5.5公斤，驮载能力达150-200公斤。

苏尼特驼

分布于内蒙古苏尼特左旗等地，年产毛5公斤左右，屠宰后可产净肉450-480公斤。

三、其他相关说明

双峰驼的细分品种：

新疆驼、阿拉善驼、苏尼特驼等均属于双峰驼分支，但阿拉善和苏尼特原产内蒙古，新疆驼是本土进化品种。- 野骆驼：新疆东南部罗布泊有野骆驼分布，属国家一级保护动物，但数量稀少。

以上品种均适应新疆恶劣环境，兼具驮运、产毛、产奶等功能，是当地重要的特色畜种。