一、通过NCBI数据库查询
基因符号(Symbol)查询 访问NCBI官网,选择`Gene`数据库,输入基因符号(如`ACTB`)或别名(如`βActin`),即可获取基因详细信息。
示例:输入`ACTB`后,描述栏会显示`actin, beta`,官方符号即`ACTB`。
蛋白序列查询
在NCBI主页的搜索框输入蛋白序列(如`insulin`),系统会返回匹配的基因名称(如`INS`)。
通过`NCBI`的`protein`选项卡,输入完整蛋白名(如`human insulin`)也可实现。
基因组序列查询
若已知基因序列ID(如`INS`),可在`NCBI`的`Nucleotide`数据库中输入ID进行检索。
二、使用专业基因信息平台
GeneCards
输入蛋白序列后,可获取基因名称、功能注释等详细信息。
HGNC(人类基因命名委员会)
提供官方基因符号查询服务,支持人类和小鼠基因的符号验证。
三、其他实用技巧
同源序列比对: 使用BLAST工具将未知序列与数据库中的同源序列比对,通过比对结果推断基因名称。 文献检索
四、注意事项
基因名称与符号的差异:
基因名(如`ACTB`)是文献中常用的描述性名称,而符号(如`ACTB`)是NCBI等数据库的标准标识,两者指向同一基因。
旧符号(如`βActin`)在数据库中可能仍被使用,但建议优先使用官方符号进行检索。
多物种基因的多样性
同一蛋白可能在不同物种中存在多个基因(如`insulin`对应`INS`、`HBA1`等),需根据物种和亚基类型区分。
通过以上方法,可高效获取基因名称及相关信息。若需进一步验证,建议通过NCBI或HGNC等权威平台交叉确认。