小学生素质综合评价手册中，父母的工作单位是可以填写会计的。

根据《教育部关于建立中小学生综合素质评价制度的指导意见》，学生综合素质评价应包括学生的基本信息、学业水平、身心健康、艺术素养、社会实践等多个方面。其中，基本信息部分要求填写学生的家庭成员和监护人信息，包括工作单位、职务等。

因此，在填写小学生素质综合评价手册时，父母的工作单位填写会计是符合规定的。这有助于学校更好地了解学生的家庭背景，便于与学生家长联系和沟通，从而更好地进行学生管理。