电影《重庆森林》中的两对男女最后并没有在一起。

在电影《重庆森林》中，金城武饰演的角色最后因为分手而伤心生病，但在遇见林青霞后却意外陷入了爱情中。然而，两个人最终没有在一起，林青霞还是离开了金城武。

另一段爱情故事中，快餐店新来的女招待阿菲爱上了时常光顾快餐店的编号223的警察，但阿菲此时已经带上了戒指，并且反复出现，暗示她可能已经结婚。

综合以上信息，可以得出结论：在电影《重庆森林》中，两对男女最后并没有在一起。