蘑菇名字的历史可以追溯到 宋元时期。据专家考证，“蘑菇”这个名字第一次出现在这一时期。在这之前，蘑菇有多种称呼，如“摩菇”、“磨菇”、“藦菇”、“蘑菰”等，这些都可以看作是“蘑菇”同音字的任意组合。直到清代，定居南京的袁枚著《随园食单》，才将这个物种的众多名字统一改写为“蘑菇”。同时期清代官方编修的《畿辅通志》一书中，也将其称为“蘑菇”。从这个时候起，“蘑菇”才正式成为通行的名称。

有专家认为，“蘑菇”其实就是一个外来词。在蒙古语里，人们把草原上随处可见，牧民都喜欢吃的真菌称为（moog）。南宋时期，蒙古人南下，带来他们的文化。受此影响，人们将这种食材称为moog，音译过来，就是“蘑菇”。

此外，我国吃蘑菇的历史可以追溯到公元前4000年到公元前3000年的仰韶文化时期。最早的文字记载“味之美者，越骆之菌”出自《吕氏春秋·本味篇》（约完成于公元前239年），距今也有2200多年了。而这被古人视为美味珍馐的越骆之菌，便是我们现在餐桌上常见的香菇。