《汤姆·索亚历险记》中以下地方可能会让读者产生疑问：

他们为什么目睹杀人，却闭口不提此事。

汤姆的一些能力到底是怎么培养出来的。

在野餐活动中，汤姆和贝琪在一个岩洞里迷了路，整整三天三夜饥寒交迫，面临着死亡的威胁……最终，他们走出了山洞，村里人发现他们，他们讲述了在洞中的经历，之后，村人用铁板堵住了山洞口。汤姆和贝琪告诉村里人在山洞里见到了杀人犯印江·乔埃，当村人在洞中找到印江·乔埃时，他已经死了。

汤姆和哈克重返山洞，找到了一笔宝藏，成了这个村的小英雄。人们都感激他。

凶杀案发生以后，验尸的那点儿，有个描写：几分钟后，在验尸的时候，印地安·乔先是发誓，然后又不慌不忙地把那套谎话重复了一遍。

镇上要开庭审理彼得杀人案了，汤姆和哈克出庭为彼得作证。

汤姆和哈克在杰克逊岛当“海盗”的内容是什么，到底有多快乐。

这些疑问可能会引发读者对小说情节、人物动机和小说主题的深入思考。建议读者在阅读整本书时，结合上下文和作者的写作风格，以便更好地理解这些情节和人物行为。