在《汤姆索亚历险记》中，汤姆和蓓姬在山洞里历险时遇到了以下困难：

迷路：

汤姆和蓓姬在洞中迷路，两人筋疲力尽，不知所措。

饥饿：

他们没有食物，汤姆把食物留着给蓓姬吃，自己则靠吃树皮和石头维持生命。

干渴：

他们找到了水源，但水很少，必须节省使用。

黑暗：

洞内一片漆黑，他们只能依靠蜡烛或手电筒照明，而蜡烛用完则使他们陷入更加恐惧的境地。

恐惧：

他们害怕寂静和黑暗，蓓姬甚至绝望地想要等待死亡。

声音：

蓓姬害怕寂静，要求汤姆多说话，但说话过多又导致口干舌燥。

坏人：

他们遇到了印第安人乔，这个在逃杀人犯差点发现了他们，幸好汤姆机智地躲藏起来。

出口：

最终，汤姆通过自己的聪明才智和勇敢，找到了山洞的隐秘出口，带着蓓姬逃离了山洞。

这些困难考验了汤姆和蓓姬的勇气、智慧和友情，最终他们成功脱险。