《汤姆·索亚历险记》的情节主要包括以下几个方面：

汤姆的日常冒险：

汤姆是一个聪明但调皮的男孩，他受不了姨妈和学校老师的管束，常常逃学闯祸。他喜欢钓鱼、和流浪儿哈克贝利·芬去闲逛、玩“海盗”、搜集各种奇怪的物品等。

墓地惊魂：

一天深夜，汤姆和哈克到墓地玩耍，无意中目睹了一起凶杀案的发生。印江·乔埃杀害了医生，并嫁祸于被打昏的波特。两人害怕被报复，立誓保守秘密。

海盗生活：

汤姆和哈克决定离家出走，成为海盗。他们在密西西比河上的小岛上搭起简易房，过起了自由自在的生活。镇上的人们以为他们淹死了，正在为他们举行葬礼。这时，汤姆和哈克却意外地出现在了自己的葬礼上。

正义的伸张：

法庭很快公开审理那桩谋杀案。在大家都以为凶手是彼得时，汤姆克服恐惧，出庭为彼得作证，告发了印第安乔，使波特无罪释放。

山洞历险：

在一次野餐活动中，汤姆和他心爱的姑娘贝琪在一个岩洞里迷了路，整整三天三夜饥寒交迫，面临着死亡的威胁。后来终于成功脱险，和好友哈克一起找到了凶手埋藏的宝藏。

宝藏的发现：

汤姆和哈克回到山洞，找到了印江·乔埃埋藏的宝藏，成为小镇上的风云人物。

这些情节有机地交织在一起，使全书具有较强的戏剧色彩，同时也生动地再现了南北战争前的一个美国边疆小镇的生活景象。