当你的男友对他的女闺蜜说“有趣的灵魂”时，他可能是在表达以下几种意思：

欣赏她的智慧和个性

他认为这个女闺蜜具有聪明、幽默、独特见解或创新思维等内在品质。

这句话可以解读为男方认为女方欣赏那些不仅外表优秀，而且内心也富有魅力的人。

喜欢她的内在品质

“有趣的灵魂”通常指的是一个人的内在品质，包括智慧、幽默、独特见解或者创新思维等方面。

这句话也可以被理解为男方认为女方喜欢那些思想深邃、有创意和智慧的人，而不仅仅是外表漂亮或者只追求物质生活的人。

欣赏她的独立和自由

“有趣的灵魂”还可以代表独立、自由的灵魂，不会受到来自外界的束缚，能够始终坚持做自己认为正确的事情的人。

这句话可能意味着男方认为女闺蜜具有坚定的个性和自主的精神。

欣赏她的善解人意和欢乐

“有趣的灵魂”还可以指虽然没有漂亮的外表，但是有一颗懂得善解人意的心，能够给人带来欢乐和人生的价值。

这句话可能表明男方认为女闺蜜不仅外表可能不是最出众的，但她的内心充满了善意和快乐，能够感染周围的人。

总的来说，当你的男友对他的女闺蜜说“有趣的灵魂”时，他很可能是在赞美她的内在品质、智慧、独立性和善良。这是一种对女闺蜜个性和魅力的高度赞赏和认可。