百度文库 或 豆瓣读书：

如果你是想找学校课本的笔记，大学以上的学科可能没有合适的网站。

涂书笔记：

主打笔记记录功能，支持多种格式电子书导入，边读边做笔记。

Shelfie：

一款读书笔记应用，方便用户整理和查找读书笔记。

晒书房：

提供读书笔记的存储和分享功能。

识墨笔记：

支持多种格式的电子书导入和笔记管理。

读书笔记：

一款简单易用的读书笔记应用。

萝卜书摘：

专注于书籍摘要和笔记的生成。

MarginNote 3：

集阅读、笔记、思维导图于一体的工具，支持多种格式电子书导入，自动将笔记内容转化为思维导图和大纲。

印象笔记（Evernote）：

老牌笔记应用，具有强大的跨平台同步能力和丰富的笔记功能，支持多种形式的笔记输入和搜索。

OneNote：

微软推出的全能型笔记应用，支持手写输入、图片插入、表格制作等多种功能，并支持跨设备同步。

爱搜书网：

全球最大的电子书搜索引擎，提供电子书资源的垂直搜索服务，并拥有强大的电子书阅读器eREAD。

漂流书：

图书资源共享平台，可以免费借书，无续返还。

幕布：

清单式的笔记工具，通过树形结构组织内容，让笔记更有条理性。

敬业签读书笔记软件：

支持分类记录、大段文字记录、统计字数、上传书本截图、照片、音乐、视频、文档等文件。

boardmix：

在线的协作式白板平台，可以用于制作视觉读书笔记。

这些软件各有特点，用户可以根据自己的需求选择合适的工具来记录和搜索读书笔记。