三体系审核的内容主要包括以下几个方面：

组织运行

是否按组织职能运行

是否符合体系标准规定

是否符合相关法律法规

是否符合公司规章制度

文件资料

组织职能相关文件

体系相关受控文件

法律法规识别与合规性评价

环境因素/危险源识别与评价

目标、指标与控制方案

工作计划与工作实际记录台账

培训计划与培训实际记录及台账

内外部信息交流台账

应急预案及应急演练报告

纠正措施及整改报告

体系运行相关记录台账

现场运行

是否合法合标合规

现场记录是否和历史记录相符

局部是否有不符合现象

食堂管理 （针对企业食堂）：

营业执照副本和食品经营许可证原件的审核

各类管理制度的审查，包括食品安全管理制度、卫生管理制度、员工培训制度、食品留样制度等

留样制度的具体内容和执行情况的检查

食堂管理人员对制度的熟悉程度和执行效果的评估

文献资料控制

文献的编制、同意、发放、更改、再同意和归档管理

与质量、环境和职业健康安全活动有关的行政文献和外来文献的及时转发

文献公布的范围和管理

环境因素和危险源的识别与控制

培训需求的确定和培训计划的制定与实施

职责范围内的文献和记录的编制、管理和归档

监视和测量

对质量、环境和职业健康安全的监视和测量活动的实施情况

监视和测量设备的配备和管理

监视和测量结果的分析、报告和评价

不合格处置

不合格品的识别、记录、评审和处置情况

纠正措施和纠正措施的验证情况

分析和持续改进

对审核结果的分析和评价

持续改进计划的制定和实施情况

内部审核和管理评审的实施情况

监督审核提示

认证证书/标志的使用情况

认证范围及使用场所和范围

认证内容的完整性、充分性、适宜性、有效性及控制

记录表式的填写和控制

监视和测量的记录

不合格处置的情况

分析和持续改进的情况

上次不符合项的跟踪和纠正措施的实施情况

其他特定要求

生产、检测设备的配备和生产环境是否满足相关要求

生产、检测设备的管理状况及检测环境是否满足要求

生产过程是否符合工艺要求和安全操作规程的要求

产品标识、状态标识、危险化学品的警示标识及贮存环境是否满足要求

文件、记录的保管条件是否满足要求

废弃物、废水、废气、固体废弃物的排放点及处理现场的管理情况

危险化学品仓库的管理状况

特种设备的使用与维护情况

生产作业场所尘、毒点的管理状况

管理方案的实施情况和进度

这些内容构成了三体系审核的全面框架，确保企业在质量、环境和职业健康安全方面的管理体系有效运行和持续改进。