卡夫卡的短篇小说主题内涵丰富多样，主要包括以下几个方面：

人性的探索

卡夫卡的作品中充满了对人性乃至人类社会问题的思考和探索。例如，《变形记》中的格雷戈尔·萨姆萨变成昆虫的情节，揭示了人在社会中的地位和身份问题，以及个体在这个社会中扮演的角色和主观意识的确立。

权力的控制

卡夫卡的作品中，有许多涉及到权力关系的刻画。如《审判》中的约瑟夫·凯式被一群官僚所困扰，反映了当时欧洲社会政治体系的虚伪和不稳定。

逃避的心理

在卡夫卡作品中，许多人物的主观意识是深受现实世界的压抑和逃避心理的影响。例如，《城堡》中的卡尔·约瑟夫被拒之门外，却依然怀抱对城堡的信仰，这种逃避现实的心理成为卡夫卡作品的重要特征之一。

对存在的疑问

卡夫卡作品中，存在问题也是一个重要的主题。例如，《变形记》中的格雷戈尔·萨姆萨所遭受的变故，让他对自己的身份和存在产生了质疑；《城堡》中的卡尔·约瑟夫，无论如何也无法确定自己是否真正地存在。

精神困境和人生苦难

卡夫卡的小说大都是关于精神困境和人生苦难的描写。他深刻探讨了人性的种种矛盾和境遇的无奈，如《变形记》中的身份认同和羁绊束缚，以及《城堡》中的官僚体制和等待的绝望。

社会缺陷和不足

卡夫卡的小说中，社会常常被描绘为高度机械化的，像机器一样执行各种命令的系统。例如，《审判》中主人公约瑟夫被深深地卷入了法律系统中，并被当做了代表社会的机器对待。

自我认同和肉体

卡夫卡的小说中还涉及到了自我认同、自我概念和肉体等主题。他详细描绘了按照传统观念安排的生活方式中的不适，并探讨了人们想要和自己的肉体和意识上的世界相抗争，但完全无法控制所处的环境。

宗教主题

卡夫卡的小说中也涉及到了宗教、超自然、幻觉等主题。他的小说以率真的象征手法来描述一些具有神秘属性的东西，但这些事情与现实世界之间的跨度极大，常常会被忽视。

综上所述，卡夫卡短篇小说的主题内涵主要围绕人性的探索、权力的控制、逃避的心理、对存在的疑问、精神困境和人生苦难、社会缺陷和不足、自我认同和肉体以及宗教主题展开。这些主题不仅反映了卡夫卡对个体和社会的深刻思考，也体现了他对人类存在和自由的复杂情感。