《小英雄雨来》的故事发生在 抗日战争时期的晋察冀边区，主要讲述了12岁的雨来如何掩护交通员李大叔，与日本鬼子进行勇敢斗争的故事。

故事背景设定在晋察冀边区的北部，有一个名叫芦花的小村庄，12岁的雨来就生活在这里。雨来从小就在河里游泳，练就了一身好水性，因此被村里人亲切地称为“小鸭子”。

一天早晨，雨来正在家里拿着课本准备去上学，突然，区上的交通员李大叔闯了进来。李大叔急匆匆地把一个盛着水的大水缸搬开，跳进了水缸下面的洞里，并对雨来说：“外面有鬼子在追我，你快把缸搬回来堵上洞口，对谁也不许说。”雨来立刻用尽全身力气，把缸搬了回来。

随后，十几个日本鬼子端着刺刀冲了进来，带头的是一个满口金牙的鬼子军官。他假装温和地对雨来说：“小孩，不要害怕，皇军是爱护你们的!刚才有个八路跑了进来，你看见了没？”雨来用手抹了抹鼻子，嘟嘟囔囔地说：“我在屋里，什么都没看见。”鬼子军官见雨来不说，又用糖块和金戒指去引诱他，但雨来仍然坚定地回答：“我，没看见，我就是没看见!”。

鬼子军官气急败坏，把雨来打了两巴掌，又把他的后脑勺狠狠地撞在门板上，最后大喊：“枪毙，枪毙!拉出去，拉出去!”河岸边响起了“砰砰”几声枪响，芦花村里的乡亲们都以为雨来被日本鬼子打死了，纷纷伤心地哭了起来。然而，雨来并没有死，他趁鬼子不注意，跳进了河里，成功脱险。

雨来的故事展现了抗日战争时期，尽管孩子们年纪小，但他们满怀爱国热情，胆大心细，勇敢无畏，机智地与凶狠的敌人做斗争，为打败日本侵略者做出了自己的贡献。