文殊院最有名的三副对联及其意思如下：

弥勒殿对联

上联：“大肚包罗现前住位兜率主；微笑圆融当来出世弥勒尊”

下联：此联未提供，但通常弥勒殿的对联会与弥勒佛的形象和精神内涵相关，如包容和乐观。

意思：这副对联生动形象地描绘了弥勒佛的形象和精神内涵。弥勒佛大肚能容，代表着包容万物的胸怀；微笑圆融，则体现出一种豁达、乐观的态度。此对联表达了人们对弥勒佛的敬仰和对这种包容、乐观精神的追求。

大殿门对联

上联：“见了便做做了便放下了了有何不了”

下联：“慧生于觉觉生于自在生生还是无生”

意思：这副对联充满禅意，根据禅宗的十二字真言“斩无明，断执著，起智慧，证真如”而作。上联的意思是，遇到该做的事情就去做，做完后就放下，不要有所牵挂，没有什么事情是不能放下的；下联探讨了智慧、觉悟和生命本质的关系，智慧源于觉醒，而觉醒来自于内心的自由和自在，生命不断延续变化，但真正的觉悟是认识到生死背后的无生本质，即超越生死的永恒存在。

宸经宝楼前对联

上联：“是名忍辱波罗密”

下联：“普放无数光明云”

意思：这对联是篆体，不大好认。上联“是名忍辱波罗密”赞美佛陀和玄奘法师经历种种苦行、忍辱；下联“普放无数光明云”则通过“云深”与“月澹”指环境的静谧与美丽，通过一指禅的典故，来修持禅宗不立文字、教外别传的精髓。在自然中修行，通过内心的觉悟达到精神升华的禅意。

这三副对联不仅体现了文殊院的禅意和文化底蕴，也传达了佛教的智慧和修行理念，是游客和信徒们喜爱的对联。